水箱消毒器也称水箱自洁消毒器，是针对水箱及水池中常见的菌藻滋生、水质二次污染等问题而开发的水处理设备。水箱消毒器可分为两类：一类是臭氧型水箱自洁消毒器，另一类是微电解型自洁消毒器。

微电解是通过外加电场破坏细胞膜上的离子通道，改变调节细胞功能的内控电流，从而影响细菌的生命活动。含菌液体流过强电场时，瞬间变化的电流通过液体，在导电通路上的细胞被高速运动的电子冲击致死；电场处理水过程中，溶解氧得到活化，产生O₂⁻、OH、H₂O₂及¹O₂等活性氧，对有机体产生一系列作用。

臭氧型水箱消毒器是空气通过高频高压电场，使氧气转化为臭氧，并及时与水混合，利用臭氧的强氧化作用来杀灭水中细菌、微生物。

水箱自洁消毒器具有广谱性，可杀灭水中微生物，不仅对水体消毒、杀菌，还能对水箱及水池起到消毒、杀菌作用，并具有一定的持续消毒效果。

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